Escala los flujos de trabajo de química con SQD usando Fulqrum
Fulqrum es un paquete de software que calcula valores propios y vectores propios de hamiltonianos proyectados en un subespacio. Construye una representación portátil del hamiltoniano proyectado que puedes pasar al solucionador de valores propios que prefieras, incluidos los solucionadores estándar disponibles de serie. Estos solucionadores pueden ofrecer una alternativa mucho más rápida al solucionador PySCF predeterminado que el addon de SQD usa para la diagonalización. Para obtener información sobre cómo instalar y usar Fulqrum, consulta la documentación de Fulqrum.
El módulo addon_sqd_support de Fulqrum construye un solucionador que diagonalize_fermionic_hamiltonian acepta directamente, de modo que pasas las mismas integrales a ambos y Fulqrum se encarga de la proyección y la diagonalización.
Para más detalles sobre el código de SQD utilizado en este ejemplo, consulta el tutorial del hamiltoniano químico.
# Added by doQumentation — installs the packages this notebook needs if they are missing
import importlib.util
_needed = {"fulqrum": "fulqrum", "numpy": "numpy", "primme": "primme", "pyscf": "pyscf", "qiskit_addon_sqd": "qiskit-addon-sqd"}
_missing = [pip for module, pip in _needed.items()
if importlib.util.find_spec(module) is None]
# One at a time, so a package that fails to install does not block the others
for _pip in _missing:
%pip install -q {_pip}
if not _missing:
print("\u2713 All required packages are installed")
import numpy as np
import pyscf
import pyscf.cc
import pyscf.mcscf
from fulqrum.addon_sqd_support import sci_solver_from_integrals
from qiskit_addon_sqd.counts import generate_bit_array_uniform
from qiskit_addon_sqd.fermion import diagonalize_fermionic_hamiltonian
# Build N2 molecule
mol = pyscf.gto.Mole()
mol.build(
atom=[["N", (0, 0, 0)], ["N", (1.0, 0, 0)]],
basis="6-31g",
symmetry="Dooh",
)
# Define active space
n_frozen = 2
active_space = range(n_frozen, mol.nao_nr())
# Get molecular integrals
scf = pyscf.scf.RHF(mol).run()
num_orbitals = len(active_space)
n_electrons = int(sum(scf.mo_occ[active_space]))
num_elec_a = (n_electrons + mol.spin) // 2
num_elec_b = (n_electrons - mol.spin) // 2
cas = pyscf.mcscf.CASCI(scf, num_orbitals, (num_elec_a, num_elec_b))
mo = cas.sort_mo(active_space, base=0)
hcore, nuclear_repulsion_energy = cas.get_h1cas(mo)
eri = pyscf.ao2mo.restore(1, cas.get_h2cas(mo), num_orbitals)
# Compute exact energy
exact_energy = cas.run().e_tot
# Create a seed to control randomness throughout this workflow
rng = np.random.default_rng(24)
# Generate random samples
bit_array = generate_bit_array_uniform(
10_000, num_orbitals * 2, rand_seed=rng
)
# Build a solver that diagonalizes with Fulqrum. It converts the integrals to a
# Fulqrum operator once, then projects onto each subspace the SQD loop requests.
sci_solver = sci_solver_from_integrals(hcore, eri, tol=1e-12)
# Run SQD
result = diagonalize_fermionic_hamiltonian(
hcore,
eri,
bit_array,
samples_per_batch=300,
norb=num_orbitals,
nelec=(num_elec_a, num_elec_b),
num_batches=5,
max_iterations=5,
sci_solver=sci_solver,
symmetrize_spin=True,
seed=rng,
)
WARN: Unable to to identify input symmetry using original axes.
Different symmetry axes will be used.
converged SCF energy = -108.835236570774
CASCI E = -109.046671778080 E(CI) = -32.8155692383188 S^2 = 0.0000000
print(f"Exact energy: {exact_energy}")
print(f"Estimated energy: {result.energy + nuclear_repulsion_energy}")
Exact energy: -109.04667177808024
Estimated energy: -109.03402667559365
Usa un solucionador de valores propios diferente
Dado que Fulqrum expone el hamiltoniano proyectado como un scipy.sparse.linalg.LinearOperator estándar, puedes diagonalizarlo con cualquier solucionador de valores propios que elijas en lugar de depender de scipy.sparse.linalg.eigsh. Esto facilita sustituirlo por un solucionador que se adapte mejor al tamaño de tu problema o a tu hardware.
Pasa el solucionador de valores propios que quieras como argumento eigensolver. Como ejemplo, esta guía muestra PRIMME, una biblioteca de solucionadores de valores propios de alto rendimiento. Su interfaz de Python, primme.eigsh, sigue una convención de llamada similar a scipy.sparse.linalg.eigsh, por lo que puedes usarla como sustituto directo.
import primme
# Build a solver that diagonalizes with PRIMME instead of the default,
# scipy.sparse.linalg.eigsh
sci_solver = sci_solver_from_integrals(
hcore, eri, eigensolver=primme.eigsh, tol=1e-12
)
# Run SQD using the PRIMME-based solver
result = diagonalize_fermionic_hamiltonian(
hcore,
eri,
bit_array,
samples_per_batch=300,
norb=num_orbitals,
nelec=(num_elec_a, num_elec_b),
num_batches=5,
max_iterations=5,
sci_solver=sci_solver,
symmetrize_spin=True,
seed=rng,
)
print(f"Exact energy: {exact_energy}")
print(f"Estimated energy: {result.energy + nuclear_repulsion_energy}")
Exact energy: -109.04667177808024
Estimated energy: -109.03937429196168